MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria ivanovii subsp. ivanovii PAM 55

Total Repeats: 55821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016011	CAAT	2	8	321	328	50 %	25 %	0 %	25 %	347547511
2	NC_016011	A	8	8	363	370	100 %	0 %	0 %	0 %	347547511
3	NC_016011	CAA	2	6	406	411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547511
4	NC_016011	TCAT	2	8	416	423	25 %	50 %	0 %	25 %	347547511
5	NC_016011	AAT	2	6	456	461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547511
6	NC_016011	AAG	2	6	565	570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547511
7	NC_016011	TGA	2	6	611	616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547511
8	NC_016011	GCA	2	6	705	710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347547511
9	NC_016011	CT	3	6	751	756	0 %	50 %	0 %	50 %	347547511
10	NC_016011	GGA	2	6	765	770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347547511
11	NC_016011	ATGC	2	8	795	802	25 %	25 %	25 %	25 %	347547511
12	NC_016011	CAA	2	6	819	824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547511
13	NC_016011	TTA	2	6	880	885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547511
14	NC_016011	ATA	2	6	898	903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547511
15	NC_016011	GAA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547511
16	NC_016011	TGA	2	6	953	958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547511
17	NC_016011	AAG	2	6	979	984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547511
18	NC_016011	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547511
19	NC_016011	AACAAA	2	12	1030	1041	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	347547511
20	NC_016011	TTA	2	6	1042	1047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547511
21	NC_016011	CCA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347547511
22	NC_016011	TAA	2	6	1120	1125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547511
23	NC_016011	A	6	6	1173	1178	100 %	0 %	0 %	0 %	347547511
24	NC_016011	TTC	2	6	1289	1294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347547511
25	NC_016011	TAAA	2	8	1300	1307	75 %	25 %	0 %	0 %	347547511
26	NC_016011	GCA	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347547511
27	NC_016011	TTA	2	6	1372	1377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547511
28	NC_016011	ACGT	2	8	1417	1424	25 %	25 %	25 %	25 %	347547511
29	NC_016011	AGA	2	6	1427	1432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547511
30	NC_016011	A	7	7	1442	1448	100 %	0 %	0 %	0 %	347547511
31	NC_016011	AG	3	6	1497	1502	50 %	0 %	50 %	0 %	347547511
32	NC_016011	TGA	2	6	1532	1537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547511
33	NC_016011	TGG	2	6	1541	1546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547511
34	NC_016011	A	6	6	1579	1584	100 %	0 %	0 %	0 %	347547511
35	NC_016011	ACT	2	6	1592	1597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547511
36	NC_016011	A	7	7	1639	1645	100 %	0 %	0 %	0 %	347547511
37	NC_016011	AAC	2	6	1939	1944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547512
38	NC_016011	ATG	2	6	1980	1985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547512
39	NC_016011	ATG	2	6	2052	2057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547512
40	NC_016011	TGG	2	6	2083	2088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547512
41	NC_016011	TCG	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347547512
42	NC_016011	AGA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547512
43	NC_016011	CAT	2	6	2199	2204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547512
44	NC_016011	TACT	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	347547512
45	NC_016011	GCCTT	2	10	2415	2424	0 %	40 %	20 %	40 %	347547512
46	NC_016011	TGA	2	6	2452	2457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547512
47	NC_016011	TAAA	2	8	2499	2506	75 %	25 %	0 %	0 %	347547512
48	NC_016011	GAT	2	6	2513	2518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547512
49	NC_016011	AAC	2	6	2549	2554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547512
50	NC_016011	A	6	6	2572	2577	100 %	0 %	0 %	0 %	347547512
51	NC_016011	TAT	2	6	2580	2585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547512
52	NC_016011	GAAG	2	8	2603	2610	50 %	0 %	50 %	0 %	347547512
53	NC_016011	TTA	2	6	2661	2666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547512
54	NC_016011	TAA	2	6	2725	2730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547512
55	NC_016011	TCT	2	6	2774	2779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347547512
56	NC_016011	GAA	2	6	2837	2842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547512
57	NC_016011	ATG	2	6	2870	2875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547512
58	NC_016011	TGA	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547512
59	NC_016011	CAA	2	6	2961	2966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547512
60	NC_016011	TTA	2	6	3007	3012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547512
61	NC_016011	TGAT	2	8	4697	4704	25 %	50 %	25 %	0 %	347547513
62	NC_016011	TGG	2	6	4716	4721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547513
63	NC_016011	CCG	2	6	4779	4784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347547513
64	NC_016011	GA	3	6	4952	4957	50 %	0 %	50 %	0 %	347547514
65	NC_016011	TAT	2	6	5043	5048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547514
66	NC_016011	AGA	2	6	5058	5063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547514
67	NC_016011	CA	3	6	5124	5129	50 %	0 %	0 %	50 %	347547514
68	NC_016011	AGA	2	6	5217	5222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547514
69	NC_016011	T	6	6	5262	5267	0 %	100 %	0 %	0 %	347547514
70	NC_016011	GCA	2	6	5334	5339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347547514
71	NC_016011	CG	3	6	5507	5512	0 %	0 %	50 %	50 %	347547514
72	NC_016011	A	6	6	5597	5602	100 %	0 %	0 %	0 %	347547514
73	NC_016011	AATC	2	8	5606	5613	50 %	25 %	0 %	25 %	347547514
74	NC_016011	GTG	2	6	5633	5638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547514
75	NC_016011	GAT	2	6	5662	5667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547514
76	NC_016011	ACA	2	6	5718	5723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547514
77	NC_016011	GAA	2	6	5773	5778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547514
78	NC_016011	GAT	2	6	5827	5832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547514
79	NC_016011	ACTT	2	8	5846	5853	25 %	50 %	0 %	25 %	347547514
80	NC_016011	AAC	3	9	5886	5894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547514
81	NC_016011	ACT	2	6	5935	5940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547514
82	NC_016011	A	7	7	5964	5970	100 %	0 %	0 %	0 %	347547514
83	NC_016011	AGA	2	6	6030	6035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547515
84	NC_016011	AAGA	2	8	6114	6121	75 %	0 %	25 %	0 %	347547515
85	NC_016011	TTG	2	6	6182	6187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347547515
86	NC_016011	GAAATT	2	12	6226	6237	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347547515
87	NC_016011	ATA	2	6	6251	6256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547515
88	NC_016011	A	6	6	6305	6310	100 %	0 %	0 %	0 %	347547515
89	NC_016011	GTC	2	6	6314	6319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347547515
90	NC_016011	TGG	2	6	6354	6359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547515
91	NC_016011	GGCGGA	2	12	6367	6378	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	347547515
92	NC_016011	AGG	2	6	6390	6395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347547515
93	NC_016011	GTG	2	6	6494	6499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547515
94	NC_016011	GTA	2	6	6502	6507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547515
95	NC_016011	GAA	2	6	6517	6522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547515
96	NC_016011	AAC	2	6	6588	6593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547515
97	NC_016011	TTTGAT	2	12	6598	6609	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347547515
98	NC_016011	TCGTAC	2	12	6615	6626	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347547515
99	NC_016011	GAA	2	6	6682	6687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547515
100	NC_016011	CCA	2	6	6775	6780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347547515
101	NC_016011	ATTT	2	8	6781	6788	25 %	75 %	0 %	0 %	347547515
102	NC_016011	GAT	2	6	6802	6807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547515
103	NC_016011	TCATT	2	10	6857	6866	20 %	60 %	0 %	20 %	347547515
104	NC_016011	AC	3	6	6898	6903	50 %	0 %	0 %	50 %	347547515
105	NC_016011	TTA	2	6	6935	6940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547515
106	NC_016011	GC	3	6	6949	6954	0 %	0 %	50 %	50 %	347547515
107	NC_016011	CAA	2	6	6957	6962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547515
108	NC_016011	ATT	2	6	7024	7029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547515
109	NC_016011	ACAA	2	8	7062	7069	75 %	0 %	0 %	25 %	347547515
110	NC_016011	AAACT	2	10	7070	7079	60 %	20 %	0 %	20 %	347547515
111	NC_016011	TAAA	2	8	7130	7137	75 %	25 %	0 %	0 %	347547515
112	NC_016011	ATG	2	6	7141	7146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547515
113	NC_016011	A	7	7	7165	7171	100 %	0 %	0 %	0 %	347547515
114	NC_016011	GTG	2	6	7186	7191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547515
115	NC_016011	GCT	2	6	7210	7215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347547515
116	NC_016011	GC	3	6	7218	7223	0 %	0 %	50 %	50 %	347547515
117	NC_016011	TGG	2	6	7344	7349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547515
118	NC_016011	CGAA	2	8	7448	7455	50 %	0 %	25 %	25 %	347547515
119	NC_016011	TGG	2	6	7494	7499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547515
120	NC_016011	ATT	2	6	7537	7542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547515
121	NC_016011	CTT	2	6	7585	7590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347547515
122	NC_016011	CTT	2	6	7618	7623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347547515
123	NC_016011	TTATAT	2	12	7632	7643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547515
124	NC_016011	CCG	2	6	7651	7656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347547515
125	NC_016011	TA	3	6	7694	7699	50 %	50 %	0 %	0 %	347547515
126	NC_016011	AGA	2	6	7713	7718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547515
127	NC_016011	AAC	2	6	7793	7798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547515
128	NC_016011	ACA	2	6	7807	7812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547515
129	NC_016011	ACT	2	6	7833	7838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547515
130	NC_016011	CGT	2	6	7912	7917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347547515
131	NC_016011	GAA	2	6	7927	7932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547515
132	NC_016011	TAA	2	6	7963	7968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547515
133	NC_016011	TAAA	2	8	8101	8108	75 %	25 %	0 %	0 %	347547516
134	NC_016011	CAT	2	6	8119	8124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547516
135	NC_016011	TTG	2	6	8149	8154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347547516
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262	NC_016011	GTT	2	6	14367	14372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347547520
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